Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms