Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC149Q6ZUS6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC149Q6ZUS6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms