Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPGS1Q6ZTW0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms