Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM43Q6ZSC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM43Q6ZSC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms