Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SRCAPQ6ZRS2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRCAPQ6ZRS2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms