Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNW5

GDPGP1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1Q6ZNW5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPGP1Q6ZNW5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPGP1Q6ZNW5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPGP1Q6ZNW5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPGP1Q6ZNW5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPGP1Q6ZNW5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPGP1Q6ZNW5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPGP1Q6ZNW5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPGP1Q6ZNW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPGP1Q6ZNW5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms