Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KSR2Q6VAB6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KSR2Q6VAB6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms