Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms