Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms