Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM198BQ6UWH4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM198BQ6UWH4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms