Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms