Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SARM1Q6SZW1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARM1Q6SZW1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms