Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms