Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms