Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RWDD4Q6NW29 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RWDD4Q6NW29 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms