Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REEP3Q6NUK4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms