Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CGB2Q6NT52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms