Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NANOGP8Q6NSW7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms