Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms