Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA2Q69YH5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms