Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOCADQ5VW36 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms