Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DIPQ5VU43 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIPQ5VU43 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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