Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCH4

CYP4A22, Cytochrome P450 4A22, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A22Q5TCH4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A22Q5TCH4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYP4A22Q5TCH4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A22Q5TCH4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A22Q5TCH4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A22Q5TCH4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A22Q5TCH4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms