Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM78Q5T7P6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms