Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH8Q5T0T0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH8Q5T0T0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms