Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CEP170Q5SW79 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CEP170Q5SW79 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms