Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms