Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRMS1LQ5PSV4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1LQ5PSV4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms