Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC158Q5M9N0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC158Q5M9N0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms