Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITRM1Q5JRX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms