Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM61Q5EBN2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms