Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSP90AB4PQ58FF6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB4PQ58FF6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms