Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSD17B12Q53GQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms