Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms