Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms