Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP221Q4G0U5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP221Q4G0U5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms