Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPTABQ3T906 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms