Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A52Q3SY17 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A52Q3SY17 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms