Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms