Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms