Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISXQ2M1V0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms