Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN1Q16799 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTN1Q16799 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTN1Q16799 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTN1Q16799 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTN1Q16799 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN1Q16799 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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