Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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