Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDK4Q16654 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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