Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACKR1Q16570 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACKR1Q16570 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACKR1Q16570 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACKR1Q16570 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACKR1Q16570 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACKR1Q16570 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACKR1Q16570 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACKR1Q16570 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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