Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP35Q16560 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms