Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK4Q16099 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms