Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms