Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85BQ15834 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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