Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA6Q15825 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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